أيدت محكمة النقض، برئاسة المستشار حمدي أبو الخير نائب رئيس المحكمة،  يوم السبت16/9/2017، حكماً نهائياً وباتا بتأييد ثلاثة أحكام بالإعدام شنقاً بحق ثلاثة من المتهمين من عناصر جماعة الإخوان وتأييد عقوبة السجن المؤبد بحق الرئيس الأسبق محمد مرسي، في قضية التخابر مع قطر.
وجاء أسماء المتهمين المقضي بإعدامهم بحكم نهائي كالتالي:
1-المتهم محمد كيلاني مضيف جوي بشركة مصر للطيران.
وجهت له النيابة عدة اتهامات أبرزها التخابر مع دولة أجنبية بقصد الإضرار بمركز البلاد الحربي والسياسي والدبلوماسي والاقتصادي وبمصالحها القومية، مقابل تلقيه مليون دولار من دولة قطر.
2- المتهم أحمد عفيفي منتج أفلام وثائقية.
وهو منتج حر للأفلام الوثائقية، متهم حيازة التقارير والوثائق الصادرة من أجهزة المخابرات العامة والحربية والقوات المسلحة وقطاع الأمن الوطني وهيئة الرقابة الإدارية، والتي تتضمن معلومات وبيانات تتعلق بالقوات المسلحة، وأماكن تمركزها وسياسات الدولة الداخلية والخارجية وقيامه بتسليمها إلى دولة قطر.
كما وُجّهت له النيابة اتهامات بالتخابر مع دولة أجنبية بقصد الإضرار بمركز البلاد الحربي والسياسي والدبلوماسي والاقتصادي وبمصالحها القومية.
ووجّهت له تهمة إخفاء أوراق ووثائق يعلم أنها تتعلق بأمن الدولة والمصالح القومية. وأنه طلب نقوداً (50 ألف دولار) بقصد ارتكاب عمل ضار بمصلحة قومية.
ووجهت له كذلك تهمة الانضمام إلى جماعة أُسست على خلاف أحكام القانون، الغرض منها الدعوة إلى تعطيل أحكام الدستور والقوانين ومنع مؤسسات الدولة والسلطات العامة من ممارسة أعمالها والاعتداء على الحرية الشخصية للمواطنين والحقوق العامة والإضرار بالوحدة الوطنية والسلام الاجتماعي.
3- أحمد إسماعيل ثابت إسماعيل معيد بجامعة مصر للعلوم والتكنولوجيا.
وجهت له النيابة عدة اتهامات أبرزها التخابر مع دولة أجنبية بقصد الإضرار بمركز البلاد الحربي والسياسي والدبلوماسي والاقتصادي وبمصالحها القومية، مقابل تلقيه مليون دولار من دولة قطر.

تحديث 26/2/2020 : تدهورت الحالة الصحية للمواطن أحمد إسماعيل ثابت- معيد بجامعة مصر للعلوم والتكنولوجيا - داخل محبسه بسجن ليمان طرة؛ حيث يعاني من ثقب في القلب، وارتجاع أذيني في البطين الأيمن، وتضخم شديد في عضلة القلب، ومعرض لحدوث فشل قلبي مفاجئ يؤدي للموت .
ويحتاج إلى عملية قلب مفتوح بشكل عاجل إلا أن إدارة السجن ترفض السماح له بإجراء العملية ما يعرض حياته للخطر.